办理公文的整个流程主要包括以下几个步骤：
1、收到文件后，首先要进行打印，并做好收文登记。收文登记内容包括收文编号、收文日期、来文单位、文件份数、秘级等信息。如果有限办时间的文件，还需要在文件上加盖限办专用章。
2、将文件提交给办公室主任签批处理意见。根据主任的签批意见，逐一送达相关领导和部门。签完文件后，要及时收回，以防丢失。
3、对于需要签阅的文件，相关人员必须签字确认后，文件方可办完。如果需要执行或反馈办理结果的，要督促相关部门及时将结果上报，并将结果（书面材料或报表）附在文件后。
4、对办理情况进行自查，查看是否有漏签人员或漏办事项。最后，在处理标签上注明办理结果，并移交归档，一份文件才算办完。
5、对收文进行分类，特别是上级来文要及时整理分类归档存放，便于查找，并按年度进行归档。
针对公文处理方面的不足，还可以采取以下整改措施：
1、选配业务能力强的专职人员负责公文处理工作。加强人员配置，选择专业素质高、电脑操作快的人员，提高公文处理效率。
2、修订完善公文处理制度。规范公文处理的流程、标准、时限、要求等，从制度层面保证公文得到快捷、规范、无误的处理。
3、压实公文处理责任。强化公文处理人员的责任意识，将公文处理纳入绩效考核，明确要求，严格考核、兑现奖惩。
4、加强业务培训。为公文处理人员提供专业培训，提高其业务素养和专业水平。
对于发文办理和收文办理，具体程序如下：
发文办理主要包括拟稿、会商、审核、签发、核发、登记、缮印、用印或签署、分装和发出等步骤。
收文办理主要包括签收、登记、初审、承办、传阅、催办和答复等步骤。
其中，签收是指机关接到公文后进行确认、清点、核对、检查、签注等手续。登记是将收文情况进行记录，确保收文过程的有序和规范。拟办是指机关对收文进行认真的阅读分析，提出建议性的处置意见供领导审核定夺。批办是领导对公文提出处置意见。承办则是指具体的工作人员按批办意见具体处理公文所涉及的事务和问题。传阅是将公文传递给相关部门或人员阅知切实办理。催办是对办理进度进行催促检查，确保公文按时办结。答复是对需要回复的公文进行答复。办理完毕后，要进行立卷和归档，确保公文得到妥善保管。